鮑魚苗的運輸方法有干運和水運兩種，短距離運輸時間不超過15小時，可采用干運。長距離運輸應采用水運。運苗時應將鮑魚連同聚乙烯波紋板一起運輸，以免鮑苗互相擠壓，受傷死亡。也可將鮑魚苗剝離，連同海帶裝入聚乙烯網袋中運輸。
1.干運：運輸容器可采用塑料泡沫箱或木桶，必須用干凈海水充分浸泡洗刷后才能使用。在容器底部放一層已浸泡好大葉草或鮮小海帶，然后將鮑魚苗，連同附著板，或已剝離后裝小網袋，鮑魚苗放在大葉草上，一層鮑魚苗，一層大葉草或鮮小海帶，不超過三層。這種運輸方法，鮑苗分布均勻，不擠壓，不受傷，又能保持濕度，運輸成活率達到98％，是目前最好的運輸方法。
2.水運：長距離運輸時，先將鮑魚苗剝離后裝入聚乙烯網袋中，規格40×30cm的網袋可裝鮑苗1000—1500粒左右，運輸時將網袋放入船上的帆布桶中，每立方米可放鮑魚苗3000～5000粒，途中用水泵抽水，每小時更換一次新鮮海水，在流水的條件下，水運100多小時鮑魚苗成活率可達到96％，運苗時一定要選擇晴朗的好天，氣溫應在5℃以上，并要防止陽光直射，苗運到目的地后要立即裝籠下海放養，切忌過夜裝籠。
